南京祿口國際機場二期工程位于機場T1航站樓南側，工程樣式為主樓加長廊的前列式國內、國際綜合型航站樓，設計年旅客吞吐量1800萬人次。建成后可起落世界最大的民航客機——載客可達850人的空客A380。屆時，南京祿口機場將成為北京首都國際機場等大型機場之后第7座擁有4F跑道的國際機場。二期工程最大的亮點是新建T2航站樓。T2航站樓位于現有航站樓南側，并配以地面綜合交通系統、停車等配套設施及相應的貨運、市政、辦公區等設施和旅客過夜用房，建成后將是我省單體最大的建筑。該方案外形呈弧形大屋蓋狀，候機大廳寬敞明亮，比較符合祿口機場現有的航站樓設計風格，可為旅客營造人性化和舒適的候機空間；在功能布局和旅客流程的設計上也較為合理，整個建筑體與地面交通中心形成一體化，可為旅客提供便捷舒適的交通換乘服務。